Samo umieszczenie leku na liście refundacyjnej nie zawsze pozwala pacjentowi szybko rozpocząć leczenie. Problem dotyczy części chorych zakwalifikowanych do programów lekowych, szczególnie osób z chorobami przewlekłymi i rzadkimi. Mimo spełnienia kryteriów terapii mogą one czekać na nią przez wiele miesięcy.
Programy lekowe są świadczeniami gwarantowanymi finansowanymi ze środków publicznych, podobnie jak refundowane leki wydawane w aptekach oraz terapie z katalogu chemioterapii. W przypadku recepty na lek apteczny leczenie można co do zasady rozpocząć po jej otrzymaniu. Inaczej jest w programach lekowych, gdzie znaczenie mają między innymi finanse szpitala i jego umowa z Narodowym Funduszem Zdrowia. Federacja Przedsiębiorców Polskich zwróciła się do Departamentu Równego Traktowania Kancelarii Prezesa Rady Ministrów o analizę przepisów, wskazując, że system może prowadzić do nierównego dostępu do leczenia.